Senku, một cậu bé thiên tài trong lĩnh vực khoa học, cùng với bạn thân Taiju, một chàng trai mạnh mẽ, thẳng thắn và tốt bụng. Taiju, người từ lâu theo đuổi cô bạn thuở nhỏ Yuzuriha, dũng cảm bày tỏ tình cảm của mình với cô. Tuy nhiên, đột nhiên, Senku và toàn bộ nhân loại trên thế giới bỗng chốc bị một hiện tượng bí ẩn làm biến thành đá chỉ trong một nháy mắt…!! Và khoảng 3700 năm sau đó, trong Thế giới Đá không còn văn minh, Senku và Taiju tái ngộ sau khi thoát khỏi tình trạng hóa đá, và họ quyết tâm xây dựng lại văn minh từ đầu!