Mật Mã Đen Trắng kể về nhóm tội phạm Sói Tây Bắc đã bị cảnh sát tiêu diệt năm năm trước, nhưng tên thủ lĩnh Cổ Mộc Lam, cốt cán Lão Sang và cảnh sát chìm được phái đi Lâm Kha cùng những người khác đều bị mất tích, không rõ sống chết. Năm năm sau, nhóm Sói Tây Bắc xuất hiện trở lại, để tìm được mẹ Lâm Kha, cảnh sát Sở Nhất Hàn (Vương Tử Kỳ) đã chủ động xin làm cảnh sát chìm và thâm nhập vào tổ chức tội phạm một lần nữa dưới sự hỗ trợ của Trình Phàn (Điền Vũ), cựu phó đội trưởng đội điều tra tội phạm, đồng thời là người phụ trách điều tra vụ án Sói Tây Bắc năm đó. Trong quá trình đó, Sở Nhất Hàn và Cổ Lận Na (Tô Hiểu Đồng) đã gặp nhau và nảy sinh tình cảm, cả hai cùng nhau vượt qua hàng loạt âm mưu, rồi xua tan đi màn sương mù sau nhiều tình huống nguy hiểm.