Điệp Viên Stone kể về Rachel Stone (Gal Gadot) một nhân viên tình báo của một cơ quan gìn giữ hòa bình toàn cầu mờ ám chạy đua để ngăn chặn một tin tặc đánh cắp vũ khí nguy hiểm và có giá trị nhất của cơ quan.